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根据《中华人民共和国政府和南苏丹共和国政府关于互免持外交、公务和特别护照人员签证的协定》，中国公民持有效的外交、公务、公务普通护照在南苏丹停留不超过30日可免办签证；中国公民持上述护照拟入境南苏丹停留超过30日或在南从事工作、学习、定居、新闻报道等须南主管部门事先批准的活动，应在入境前申办签证。
中国公民持普通护照，因商务、投资和民间组织活动或因研究、学习目的前往南苏丹，应事先到南苏丹驻华大使馆办理签证。对于没有取得电子签证的外国旅行者将面临罚款或遣返等处罚。入境南苏丹后，若停留期超过3日的，需在3日内持护照及有效签证前往南内政部移民与外国人管理局办理登记。
赴南苏丹前应到国内当地涉外卫生检疫部门进行体检，进行黄热病和霍乱等疫苗接种，并获取相应接种证书或记录。出发时须携带《健康检查证明书》和《国际预防接种证书》（俗称“黄皮书”）备机场入境检查。截至2023年11月，入境南苏丹仍需提供新冠疫苗接种记录（英文版）。
南机场海关工作人员对出入境普通旅客携带行李随机进行开箱检查，检查无误后方可放行，禁止携带违禁物品。出入境时请遵守南苏丹有关法律法规，展现中国公民良好形象。
在南苏丹外国公民须持有效护照和签证，到南内政部移民局进行登记；在南外籍务工人员须申请工作许可，南内政部只向持有工作许可的外籍人员签发居留许可。
外国公民与南苏丹公民结婚并在南苏丹连续生活工作满5年的，可申请加入南苏丹国籍；外国公民在南苏丹连续生活工作满10年的，可申请加入南苏丹国籍。
